Nella produzione di farmaci, al fine di garantire l'uniformità e la buona fluidità dei farmaci, le materie prime sono spesso trasformate in particelle utilizzando determinati metodi(Pillole, capsule, compresse). Utilizzando gli effetti termici e non termici delle microonde, l'essiccazione a bassa temperatura e il trattamento di sterilizzazione vengono effettuati. L'energia a microonde viene irradiata direttamente nel farmaco, causando l'aumento della temperatura interna del farmaco, generando pressione e accelerando il trasferimento di molecole di acqua confinata. L'acqua nell'elemento trattato evapora gradualmente verso l'esterno e in questo momento, la deumidificazione viene effettuata nell'apparecchiatura a microonde per rimuovere l'acqua evaporata. L'uso di essiccazione a microonde per elaborare farmaci non solo migliora notevolmente la qualità del prodotto, ma riduce notevolmente i tempi di essiccazione e risparmia molta energia, con significativi benefici economici.
Inoltre, le microonde possono asciugare, disidratare, disinfettare, sterilizzare, uccidere gli insetti e prevenire la muffa su varie medicine cinesi e occidentali e materiali medicinali. Può facilitare notevolmente lo stoccaggio e la conservazione di farmaci e materie prime dai produttori